Fuentes del sector han asegurado que el acuerdo perjudicaría "gravemente" a sectores españoles como el ganadero (especialmente en vacuno, porcino y avícola), el hortofrutícola (ajo y cítricos), el vino y los cereales, entre otros, y que las importaciones podrían provocar una brusca caída de los precios en origen de las producciones comunitarias.

Respecto al sector ganadero, las 12 asociaciones han remitido una carta conjunta a la ministra de Medio Ambiente y Medio Rural y Marino (MARM), Elena Espinosa, en la que muestran su "preocupación" por el reinicio de las negociaciones sobre un acuerdo de libre comercio con Mercosur. En ella subrayan que las conversaciones se paralizaron en 2004 por las discrepancias existentes en el sector agrícola y que aumentar las facilidades para exportar a la UE puede derivar, en su opinión, en "importantes pérdidas económicas, cifradas según distintas fuentes entre 3.000 y 5.000 millones de euros al año".

Por su parte el director de Relaciones Internacionales de Cooperativas Agro-alimentarias, Gabriel Trenzado, ha explicado que, según los estudios de impacto de la Comisión Europea, el acuerdo provocaría una reducción de algunos precios ganaderos de entre el 60 y el 90%, así como la destrucción de millones de empleos en la UE, sobre todo en granjas, centros de transformación y empresa auxiliar. Además ha añadido que el acuerdo supondría más importaciones a bajo coste sin los mismos condicionantes legales, como normas sobre bienestar animal o protección de la propiedad intelectual que afectarían, por ejemplo, a Denominaciones de Origen, y puede provocar que Mercosur exija más concesiones después en el marco de la Organización Mundial de Comercio (OMC).

El director de relaciones internacionales de la Asociación Agraria Jóvenes Agricultores (Asaja), Ignacio López, ha resaltado "los temores" de todo el sector agrario, porque un acuerdo de asociación perjudicaría a productos ganaderos, cereales, cítricos, hortalizas o zumos, provocaría "saturación" en el mercado y ocasionaría perdidas de entre 3.000 y 13.500 millones de euros en la UE.