Dos Laboratorios en España, el de Seguridad Alimentaria del Cetal y el Arbitral del MAGRAMA, serán los Laboratorios Nacionales Referencia en el Programa Nacional de Control Oficial de la Producción Primaria Agrícola.
 
Una de las principales apuestas tecnológicas de la Fundación Cetal, desde la aprobación del plan inicial de actuación en 2012, ha sido la innovación en materia de seguridad alimentaria. En este sentido se creó el LSA-Cetal, cuya dotación se completó a lo largo de los primeros meses de 2015, para así disponer de tecnología de alta precisión y especificidad, para la detección y caracterización de los diferentes patógenos de transmisión alimentaria, empleando las técnicas analíticas más novedosas en esta materia: métodos de inmunoensayo, de espectrometría de masas o caracterización molecular de cepas mediante la utilización de las metodologías más vanguardistas de análisis del ADN (REP-PCR, RT-qPCR, secuenciación completa del genoma bacteriano, etc.).
 
Una vez completado su equipamiento e incorporados los cuatro primeros técnicos especialistas, el LSA-Cetal inició el proceso de acreditación mediante la implantación de un sistema de gestión de calidad en el laboratorio basado en los requisitos de la norma UNE-EN ISO/IEC 17025 y los exigidos por la Entidad Nacional de Acreditación (ENAC). Para la consecución de esta certificación de calidad, el Cetal cuenta con el asesoramiento de Innovative Solutions in Chemistry S.L. (ISC-Science), empresa de base tecnológica con servicios de consultoría, formación, asesoramiento e implantación de sistemas de gestión de la calidad.
 
Tras la aprobación del RD 9/2015, se crea en España el Programa de Control Oficial de la Producción Primaria Agrícola, cuyo objetivo es el conocimiento de los peligros existentes y la correcta categorización de los distintos puntos de control, en base al riesgo potencial que suponen para la seguridad alimentaria las actividades en ellos desarrolladas. Entre los recursos que pondrá a disposición el Ministerio de Agricultura para la ejecución de este Programa Nacional de Control Oficial, se incluye la designación de los Laboratorios Nacionales de Referencia en las materias de control del mismo.
 
En la actualidad se está tramitando el Real Decreto que tiene como objetivo la designación de los Laboratorios Nacionales de Referencia, así como la delimitación de sus funciones, para la correcta puesta en marcha del Programa de Control Oficial de la Producción Primaria Agrícola.