Dentro del capítulo de programas ganaderos se han repartido 23.314.204 euros, de los que 12.000.000 euros han sido asignados para el Plan de ordenación del Sector Cárnico y Plan integral para los Sectores Ovino y Caprino y reparto de fondos para atender a las líneas de subvención destinadas a las agrupaciones de productores de ovino y caprino en el ejercicio 2009.

Para la línea de fomento del asociacionismo para la defensa sanitaria ganadera se han distribuido 8.000.000 euros y para el fomento de la selección y difusión de la mejora ganadera, 3.048.212 euros, de los que 1.978.908 euros se han destinado al control oficial del rendimiento lechero y 1.069.304 euros a la conservación de las razas autóctonas en peligro de extinción.

El Ministerio de Medio Ambiente, Medio Rural y Marino (MARM) detalla en un comunicado que se ha tenido en cuenta el número de asociaciones de criadores de raza en peligro de extinción reconocidas por las Comunidades Autónomas y que, ante la disponibilidad presupuestaria, se ha incrementado la cantidad por asociación a 60.000 euros.

En cuanto a la mejora de la calidad y trazabilidad de los sectores ganaderos se ha asignado un total de 180.000 euros, que van destinadas a las ayudas "de mínimis" para implantación de sistemas de autocontrol en mercados de ganado y con el que se territorializa el 100% de la cuantía asignada en 2009.

Para la Prima Nacional complementaria a la Vaca Nodriza se han repartido 85.992 euros, utilizando como criterio de asignación el número de derechos de prima por vaca nodriza comunicado por las Comunidades Autónomas.